Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kctd4Q9D7X1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kctd4Q9D7X1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kctd4Q9D7X1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms