Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp5Q9D7S9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp5Q9D7S9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp5Q9D7S9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms