Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D7E4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D7E4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D7E4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D7E4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D7E4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D7E4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D7E4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D7E4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D7E4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D7E4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D7E4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D7E4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D7E4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D7E4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D7E4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D7E4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D7E4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D7E4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D7E4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D7E4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D7E4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D7E4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms