Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl40Q9D783 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms