Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Borcs8Q9D6Y4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs8Q9D6Y4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs8Q9D6Y4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs8Q9D6Y4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs8Q9D6Y4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs8Q9D6Y4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Borcs8Q9D6Y4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms