Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc7Q9D541 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc7Q9D541 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms