Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsph14Q9D3W1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms