Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
1700034E13RikQ9D2T6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
1700034E13RikQ9D2T6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms