Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef12Q9D2F1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms