Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem88Q9D0N8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms