Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zbed3Q9D0L1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zbed3Q9D0L1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zbed3Q9D0L1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms