Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd3Q9CYW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdhd3Q9CYW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms