Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Bud23Q9CY21 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Bud23Q9CY21 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bud23Q9CY21 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms