Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl11Q9CXW4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms