Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc3Q9CW03 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms