Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atxn3Q9CVD2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn3Q9CVD2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms