Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhfpl3Q9CTN8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms