Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gnpda2Q9CRC9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gnpda2Q9CRC9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms