Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700029F12RikQ9CRB4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700029F12RikQ9CRB4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms