Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PsenenQ9CQR7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PsenenQ9CQR7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms