Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc2Q9CQP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc2Q9CQP2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms