Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Txndc17Q9CQM5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Txndc17Q9CQM5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Txndc17Q9CQM5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Txndc17Q9CQM5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Txndc17Q9CQM5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Txndc17Q9CQM5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Txndc17Q9CQM5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Txndc17Q9CQM5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Txndc17Q9CQM5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Txndc17Q9CQM5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Txndc17Q9CQM5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Txndc17Q9CQM5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Txndc17Q9CQM5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Txndc17Q9CQM5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms