Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Rpl39lQ9CQD0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rpl39lQ9CQD0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl39lQ9CQD0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl39lQ9CQD0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl39lQ9CQD0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl39lQ9CQD0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl39lQ9CQD0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl39lQ9CQD0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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