Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700129C05RikQ9CQ77 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms