Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nudcd2Q9CQ48 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms