Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NenfQ9CQ45 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NenfQ9CQ45 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms