Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a4dQ99N05 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ms4a4dQ99N05 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ms4a4dQ99N05 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ms4a4dQ99N05 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ms4a4dQ99N05 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ms4a4dQ99N05 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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