Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS7

Ehbp1l1, EH domain-binding protein 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehbp1l1Q99MS7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ehbp1l1Q99MS7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ehbp1l1Q99MS7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms