Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm2d1Q99MB3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms