Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dnaja3Q99M87 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaja3Q99M87 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms