Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprtQ99M80 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprtQ99M80 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprtQ99M80 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
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