Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fars2Q99M01 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fars2Q99M01 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms