Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gins4Q99LZ3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms