Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nus1Q99LJ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms