Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp5lQ99LH9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp5lQ99LH9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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