Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pagr1aQ99L02 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1aQ99L02 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms