Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrbp1Q99J45 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrbp1Q99J45 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrbp1Q99J45 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nrbp1Q99J45 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrbp1Q99J45 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrbp1Q99J45 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms