Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tgs1Q923W1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgs1Q923W1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgs1Q923W1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms