Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Clip1Q922J3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Clip1Q922J3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Clip1Q922J3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Clip1Q922J3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms