Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf7Q922B6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf7Q922B6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf7Q922B6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf7Q922B6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf7Q922B6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf7Q922B6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf7Q922B6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf7Q922B6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf7Q922B6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms