Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Odf3Q920N1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf3Q920N1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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