Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z40

Gbp7, Gbp6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp7Q91Z40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp7Q91Z40 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp7Q91Z40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp7Q91Z40 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp7Q91Z40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp7Q91Z40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms