Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdha12Q91Y18 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms