Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc3Q91W40 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc3Q91W40 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klc3Q91W40 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klc3Q91W40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klc3Q91W40 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klc3Q91W40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klc3Q91W40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klc3Q91W40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klc3Q91W40 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms