Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hps3Q91VB4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hps3Q91VB4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms