Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacng5Q8VHW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacng5Q8VHW4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacng5Q8VHW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms