Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sft2d2Q8VD57 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sft2d2Q8VD57 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms