Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubxn4Q8VCH8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubxn4Q8VCH8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms