Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RfxapQ8VCG9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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