Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc58Q8R3Q6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms